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E : Informatique, statistiques et calcul scientifique

Ingénieur de recherche

Concours N° 68

 

Nbre de postes : 2
Emploi-type : Expert-e en calcul scientifique

1er poste du concours N° 68

Affectation : Milieux Environnementaux, Transferts et Interactions dans les hydrosystèmes et les Sols, PARIS 05
Groupe de fonction : Groupe 3

 

Mission :  
La principale mission de l'Expert-e en calcul scientifique sera le développement
de la plateforme de modélisation pyNuts-Riverstrahler, qui décrit le
fonctionnement biogéochimique et hydrologique des cours d'eau et de leurs annexes.
Il.elle soutiendra aussi le développement d'autres modèles développés au sein de
l'UMR (hydrogéologie, géophysique, sols...) et contribuera au couplage de certains
de ces outils..



 

Activités :  
1. Intégration des codes de calcul et de modélisation :

- Participation et soutien aux développements scientifiques de la plateforme
pyNuts-Riverstrahler
- Tests, intégration et optimisation de nouveaux modules (biogéochimique,
hydrologique, physique)
- Optimisation des méthodes numériques (schéma de résolution numérique,
parallélisation, etc.)
- Développement du couplage entre modèles actuellement distincts (par coupleurs,
développement de code ad hoc, ou internalisation)

2. Traitement de données :

- Développer des codes pour prétraiter les données d'entrée des modèles
(structuration, mise en forme), incluant des traitements spatiaux temporels et
de changements d'échelle
- Développer des outils d'exploration et d'analyse des simulations produites au
sein d'un système de gestion de bases de données relationnelles
- Bancariser des données de validation pour la plateforme pyNuts-Riverstrahler à
partir des Systèmes d'informations sur la qualité des cours d'eau en France et
en Europe, ou de produits de télédétection
- Renforcer l'accessibilité des données produites à l'UMR selon les principes
FAIR.

3. Valorisation, formation et soutien aux utilisateurs :

- Participation à la valorisation scientifique de la plateforme en contribuant
au développement d'outils innovants de visualisation des simulations produites
- Rédaction de documentations techniques
- Contribution aux publications de l'unité
- Formation et soutien aux utilisateurs (chercheurs et étudiants)
- Implication dans l'animation du pôle modélisation et méthodes numériques de
l'UMR.


 

Compétences :  
Savoirs :

- maîtriser la programmation dans le domaine scientifique et le développement de
codes complexes.
- Solide expérience en programmation en python, en C ou un autre langage
structuré
- Solide expérience en traitement de données scientifiques, incluant de bonnes
compétences en géomatique (SIG et Télédétection)
- Maîtrise des méthodes numériques, des techniques de calcul intensif, des
outils de parallélisation et d'optimisation
- Maîtrise des SGBDR et du langage SQL
- Connaissance des outils de gestion de code source (git)
- Connaissances en sciences de l'environnement

Savoir-faire :

- Rigueur et persévérance dans la production de code et le traitement des
données.
- Autonomie dans les recherches d'informations, de données et la prise de
contact
- Bonne capacité à travailler en équipe, à apporter un soutien aux utilisateurs
(chercheurs et étudiants)
- Maîtrise de l'anglais scientifique oral et écrit fortement souhaitée.
- Intérêt pour les thématiques de la biogéochimie aquatique et/ou terrestre et
l'hydrologie.

Savoir-être :

- Bon relationnel et sens du travail en équipe
- Aisance dans la communication
- Disponibilité et réactivité

 

Contexte :  
METIS positionne ses recherches dans le domaine des surfaces continentales et de
l'étude de la zone critique. Elle s'intéresse plus particulièrement à la
circulation de l'eau et des éléments qui peuvent être impactés par l'homme mais
qui sont aussi une ressource sensible et indispensable au développement de la
société. Localisée sur le site Pierre et Marie Curie de Sorbonne Université
(Paris), l'UMR rassemble 50 personnels permanents et 50 contractuels.

METIS a une longue expérience de la modélisation des hydrosystèmes continentaux
(bassins versants, cours d'eau, sols, sous-sol, etc.), et toutes ses équipes
développent des outils de modélisation à des degrés plus ou moins poussés. Un pôle
« Modélisation et Méthodes numériques » a été mis en place pour mutualiser les
bonnes pratiques et faciliter l'accès aux moyens de calcul (serveurs locaux, mais
mésocentres SU et IPSL, et supercalculateurs nationaux).

La plateforme de modélisation biogéochimique pyNuts-Riverstrahler, qui a bénéficié
d'un fort soutien de la fédération FIRE, est rattachée à l'équipe Hydrosystèmes,
qui s'intéresse au fonctionnement des bassins versants. Cette équipe développe
aussi d'autres modèles, hydrologiques et hydrogéologiques, dont le modèle
ORCHIDEE, qui décrit les surfaces continentales dans le modèle de climat de
l'institut Pierre et Simon Laplace. L'équipe Géophysique développe pour sa part
des codes décrivant des processus physiques à plus petite échelle, souvent
exploités en mode inverse pour imager la sub-surface à partir d'observations. Un
objectif de l'UMR est de renforcer les couplages entre ses modèles pour mieux
décrire les interactions complexes dans les milieux continentaux étudiés, avec une
priorité affichée sur le couplage entre pyNuts-Riverstrahler et ORCHIDEE, mais
aussi entre ses modèles hydrogéologiques et géophysiques.

l'IR sera encadré par un EC (Hydrosystèmes) avec l'appui d'une IR (FIRE) pour ce
qui concerne les développements de la plateforme

2eme poste du concours N° 68

Affectation : Laboratoire d'Etudes en Géophysique et Océanographie Spatiales, TOULOUSE
Groupe de fonction : Groupe 3

 

Mission :  
L'expert-e en calcul scientifique mettra en place des simulations numériques
couplées physique, biogéochimie, éléments traces et isotopes dans l'océan.

 

Activités :  
ACTIVITES PRINCIPALES :

- Piloter le développement et la mise en place de simulations numériques couplant
i) modèle de circulation océanique, ii) modèle de biogéochimie simulant les cycles
biologiques, iii) modules géochimiques des éléments traces et isotopes.

- Développer de nouveaux modèles géochimiques simples des éléments traces et
isotopes.

- Concevoir et réaliser des tests de sensibilité

- Valider et évaluer les sorties de modèles

- Capitaliser les résultats des développements dans une bibliothèque de
paramétrisation de modèles, dans le cadre de la plateforme numérique du
laboratoire

- Piloter la formation et l'encadrement d'étudiants

- Contribuer à l'animation d'un axe thématique transverse du laboratoire


ACTIVITES ASSOCIEES :

- Assurer une veille technologique
- Participer à des projets de recherche nationaux et internationaux
- Valoriser les travaux via la rédaction de publications scientifiques ou la
participation à des conférences

 

Compétences :  
Savoirs :
- Maîtrise des techniques de modélisation couplée entre modèles de circulation
océanique (ex. NEMO, CROCO ou SYMPHONIE) et de biogéochimie (ex. PISCES ou Eco3M-
S)
- Maîtrise du calcul scientifique et connaissances en mathématiques appliquées
- Connaissances en biogéochimie marine et/ou géochimie des éléments traces et
isotopes dans l'océan
- Maîtrise des techniques de programmation, parallélisation et optimisation
- Maîtrise des langages de programmation Fortran, Matlab/Python
- Méthodologie de conduite de projet
- Maîtrise de l'anglais (compréhension écrite et orale niveau 2)

Savoir-faire :
- Piloter un projet
- Rédiger des documents
- Communiquer et faire preuve de pédagogie

Savoir-être :
- Goût pour le travail en équipe
- Goût pour la pluridisciplinarité
- Rigueur et Autonomie

 

Contexte :  
L'affectation structurelle sera le Laboratoire d'Études en Géophysique et
Océanographie Spatiales (UMR5566 LEGOS), au sein de l'Observatoire Midi-Pyrénées
à
Toulouse. La thématique générale du laboratoire concerne le cycle de l'eau, de
la
matière et de l'énergie, dans ses composantes océanique, hydrologique,
cryosphérique et atmosphérique. Cette thématique est déclinée autour de 4 thèmes
de recherche principaux : (i) dynamique océanique et variabilité climatique,
(ii)
géochimie et biogéochimie marines, (iii) mécanismes du changement global et ses
signatures régionales et (iv) cycle de l'eau et interface
océan/hydrologie/cryosphère/atmosphère.

Le LEGOS est une Unité Mixte de Recherche, placée sous la tutelle du CNES, du
CNRS/INSU, de l'IRD, et de l'Université Toulouse 3. Il regroupe environ 140
personnes, dont 43 chercheurs/enseignants-chercheurs et 24 ingénieurs et
techniciens permanents, au sein de 8 équipes de recherche. Le laboratoire a une
expertise forte en modélisation régionale océanique, côtière ou estuarienne, et
des couplages associés. Il est également un acteur majeur sur la géochimie
expérimentale des éléments trace et des isotopes dans le cadre du programme
international GEOTRACES.

L'ingénieur-e sera intégré-e à l'atelier numérique du LEGOS. Il/elle complétera
les compétences actuelles en modélisation océanique régionale en contribuant à
la
pérennisation des activités du laboratoire sur la modélisation couplée océan-
biogéochimie et au développement de nouveaux outils pour la modélisation des
cycles des éléments trace et isotopes. A l'interface de différentes équipes de
recherche du LEGOS, il/elle participera aux projets de recherche de l'unité sur
un large panel de processus océaniques couplés entre la physique, la
biogéochimie et les traceurs géochimiques à différentes échelles.

Il/Elle sera placé-e sous la responsabilité hiérarchique du responsable de
l'atelier numérique.