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B : Sciences chimiques et science des matériaux

Ingénieur d'études

Concours N° 83

 

Nbre de postes : 1
Emploi-type : Ingenieure ou ingenieur en analyse chimique


Affectation : Institut de Chimie des Substances Naturelles, GIF SUR YVETTE
Groupe de fonction : Groupe 3
Poste avec compétence(s) interdisciplinaire(s) :      BAP de la seconde discipline : A : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement      Emploi-type de la seconde discipline : Ingenieure ou ingenieur en expérimentation et instrumentation biologiques

 

Mission :  
L'ingénieur.e met en oeuvre les cultures de souches microbiennes ainsi que les
analyses chromatographiques et métabolomiques de métabolites issus de ces souches.
Il / elle réalise la gestion et le traitement des données de la souchothèque de
l'ICSN : optimisation de cette librairie (traçabilité, conservation des souches
microbiennes et des extraits associés), développement de la base de données
dédiée.

 

Activités :  
- Assurer la conservation et la préservation des souches microbiennes issues
d'holobiontes.
- Réaliser des analyses chromatographiques : chromatographie flash,
Chromatographie Liquide à Haute et Ultra Haute Performance (HPLC, UHPLC), des
métabolites issus de ces cultures.
- Optimiser les protocoles de cultures, d'extraction et les analyses
chromatographiques et métabolomiques.
- Structurer une base de données informatisée pour centraliser les informations
garantissant la traçabilité, la mutualisation et la valorisation des ressources.
- Participer à la valorisation de la souchothèque.
- Agir en appui aux projets de recherche internes et externes (accueil des
utilisateurs, suivi des projets).
- Gérer les équipements et assurer la planification des expériences.
- Assurer l'optimisation de l'utilisation des équipements mutualisés
(chromatographie, autoclaves, Poste de Sécurité Microbien, etc.), ainsi que le
suivi technique d'un parc d'une dizaine d'instruments, incluant maintenance et
calibration.
- Assurer le traitement, la synthèse et la restitution des résultats expérimentaux
sous forme de rapports scientifiques.
- Réaliser une veille scientifique (avancées en microbiologie, chimie analytique
et gestion des collections biologiques).
- Former les utilisateurs (étudiants, ingénieurs, chercheurs) aux équipements,
protocoles et bonnes pratiques de culture d'extraction et d'analyses (chimiques et
biologiques).
- Rédiger des documents techniques et veiller au respect des règles d'hygiène et
sécurité, et de conformité réglementaire (biosécurité, manipulation des micro-
organismes).
- Gérer les stocks de matériel et réactifs, anticiper les besoins.

 

Compétences :  
Savoirs :
- Microbiologie (culture, asepsie, biosécurité, cryoconservation, extraction d'ADN
pour l'identification et la traçabilité des souches). (maîtrise)
- Chimie analytique appliquée aux extraits microbiens (principes d'extraction, de
purification, chromatographie liquide et de métabolomique). (connaissance
approfondie).
- Chimie des substances naturelles et des cadres réglementaires liés aux
ressources biologiques [protocole de Nagoya, APA (Accès et Partage des Avantages),
MTA (Material transfer agreement)]. (connaissance approfondie)
Savoir-faire :
- Maîtrise des techniques de laboratoire en microbiologie et en chimie analytique
: culture et manipulation de micro-organismes, extraction et purification de
métabolites, utilisation d'instruments analytiques (HPLC, UHPLC, chromatographie
flash, autoclaves, congélateurs -80 °C), ainsi que leur maintenance, calibration
et rédaction de protocoles.
- Compétences en gestion et exploitation de données scientifiques : conception et
administration de bases de données (FileMaker Pro, Excel), suivi des équipements
et des stocks.
Savoir-être :
- Rigueur
- Autonomie et sens de l'organisation
- Capacité à travailler en équipe
- Communiquer efficacement, à l'écrit comme à l'oral, en français et en anglais
- Adaptabilité face aux évolutions scientifiques et techniques
- Esprit critique
- Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité

 

Contexte :  
L'Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN-UPR2301), situé sur le campus
de Gif-sur-Yvette (91) avec trois bâtiments (23B, 27 et 29), développe des
activités à l'interface chimie-biologie, avec les substances naturelles comme
objet d'étude et source d¿inspiration. Il est structuré en quatre départements de
recherche, un département « Collections, Plateformes et Services Scientifiques »
et un département « Administration, Logistique, Infrastructure ». Depuis plus
d'une décennie, l'ICSN a développé une expertise autour des ressources biologiques
issues des holobiontes (micro-organismes associés aux plantes et aux insectes),
conduisant à la création d'une souchothèque regroupant souches microbiennes
cultivables et extraits associés, organisée dans une base de données structurée.
Cette base constitue à la fois une banque de souches vivantes et d¿extraits
standardisés, enrichie de données analytiques et biologiques. Elle rassemble
environ 3000 souches et 700 extraits, documentés (origine, caractérisation
morphologique, chimique et génétique, séquences GenBank), en conformité avec le
Protocole de Nagoya et la législation APA.
Le/la chargé.e de la souchothèque de l'ICSN sera placé.e sous la responsabilité
hiérarchique de la responsable de la souchothèque et rattaché.e majoritairement
au département « Collections, Plateformes et Services Scientifiques » (90 %) et
pour partie au Département de recherche « Chimie des substances naturelles et
chimie médicinale » (10 %) dans le groupe Chimie fonctionnelle Ecologie chimique :
Interactions micro-organismes / hôtes macroscopiques. La personne recrutée
intégrera l'équipe de la souchothèque (localisée bâtiment 23B) composée de sa
responsable hiérarchique, qui a créé cette collection et le groupe d'écologie
chimique mentionné ci-dessus. Ce groupe est composé de la même responsable que la
souchothèque et d¿un ingénieur de recherche. Elle contribuera également à la vie
scientifique de l'unité (séminaires, conférences).