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E : Informatique, statistiques et calcul scientifique

Ingénieur de recherche

Concours N° 508

 

Nbre de postes : 1
Emploi-type : Experte ou expert en calcul scientifique


Affectation : Laboratoire d'optique et biosciences, PALAISEAU
Groupe de fonction : Groupe 2
Poste avec compétence(s) interdisciplinaire(s) :      BAP de la seconde discipline : A : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement      Emploi-type de la seconde discipline : Ingenieure ou ingenieur biologiste en analyse de données

 

Mission :  
Prendre en charge la gestion de données de bio-imagerie obtenues lors d'expériences
de
microscopie multimodale : stockage, gestion, analyse automatisée et visualisation
ainsi que ingénierie logicielle des outils développés.

 

Activités :  
- Prendre en charge l'analyse de données de certains projets, de la compréhension
et la
formalisation des besoins à la publication des résultats
- Diffuser, publier et valoriser les développements de méthodes d'analyse
- Gérer les moyens techniques et financiers alloués aux infrastructures de
stockage et de gestion des données d'imagerie du pôle Microscopie du LOB
- Mettre en place, en lien avec les avancées de la communauté sur le sujet, un
format de donnée uniforme pour les images du pôle et leur métadonnées
- Concevoir des plugins de visualisation de données d'imagerie du pôle et former
les
personnels du pôle sur ces plugins
- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique sur l'analyse
d'image, notamment en Intelligence Artificielle et sur la science ouverte
- Déployer des plans de gestion de données. Orienter et conseiller les utilisateurs
de la plateforme d'imagerie Morphoscope (IBISA/FranceBioImaging) pour l'analyse des
données
- Participer à des réseaux professionnels en analyse d'image et en science ouverte,
dans le cadre de l'infrastructure nationale France BioImaging.

 

Compétences :  
Connaissances/Savoirs :
- Traitement du signal/des images
- Science des données/intelligence artificielle
- Gestion de données massives
- Langages de programmation, en particulier en Python
- Bases de physique (instrumentation en microscopie)
- Bases de Biologie
- Notions d¿anglais appréciées

Compétences opérationnelles/Savoir-faire :
- Génie logiciel (git, test unitaire, intégration continue etc.)
- Gestion d'infrastructure d'informatique scientifique

Savoir-être :
- Autonomie
- Curiosité intellectuelle
- Capacité de prospective
- Capacités d¿analyse
- Savoir rédiger des rapports et des documents
- Connaître les techniques de communication
- Savoir piloter un projet

 

Contexte :  
Le Laboratoire d'Optique et Biosciences est une structure mixte de recherche CNRS-
INSERM-Ecole polytechnique composée d'environ 70 personnels (25
chercheurs/enseignants-chercheurs), 14 ITA, ~30 doctorants/post-doctorants), située
sur le campus de l'Ecole polytechnique à Palaiseau. Il rassemble
des compétences en biologie moléculaire et cellulaire, en optique et dynamique
femtoseconde, dans le but de développer des synergies et de favoriser l'émergence
de nouveaux concepts et outils, en particulier pour la compréhension du
fonctionnement des biomolécules et de leur organisation au sein des cellules et
tissus. L'ingénieur-e travaillera au sein du pôle "Microscopies avancées et
physiologie des tissus" du LOB (composé de 12 chercheurs et 15 doctorants-post-
doctorants).
qui développe de nouvelles techniques de microscopie avec des applications à de
nombreux problèmes complexes de biologie.
Il-elle sera directement rattaché-e hiérarchiquement au Directeur d'Unité.

Cette fonction ouvre droit à la perception de l'Indemnité de Référence pour les
Informaticiens (IRI).